総務課、介護保険課、業務管理課を設置し、組合運営を統括するとともに、あらたな広域行政の展開に取り組んでいます。
平成7年度から財務会計システム、人事給与システムを導入し、行財政事務の効率的運営に努めています。また、介護保険課では平成13年度から介護認定審査会支援システムを導入し、構成市町間をネットワーク化、平成15年度からはペーパーレス介護認定審査会システムを導入し、要介護認定業務の効率化・迅速化を図っています。
介護認定審査会は、委員定数120人以内、合議体数16以内で荒尾会場、玉名会場の2会場で開催しています。障害者総合支援審査会は、委員定数20人以内、合議体数3以内で荒尾会場、玉名会場の2会場で開催しています。
また、平成22年度からは結婚活動支援事業を開始し、荒尾・玉名地域結婚サポートセンター「KOIBANA」を開設して結婚を望む独身者へ出会いのきっかけ作りと交際から成婚までの過程をサポートしています。